L’Usep est partenaire du Comité national olympique et sportif français (CNOSF), de l’Union nationale du sport scolaire (UNSS) et de plus de 40 autres fédérations sportives.

L’Usep est partenaire de l’Ufolep (Union française des œuvres laïques de l’éducation physique), avec laquelle elle constitue le secteur sportif de la Ligue de l’enseignement.

Elle a signé par ailleurs des conventions avec 43 fédérations françaises (FF) :